Santri Pondok Pesantren Al Muttaqin berada di asrama selama 24 jam per hari, dengan aktivitas sebagai berikut :
| WAKTU | KEGIATAN |
| 03.00 – 04.00 | Bangun Sholat malam |
| 04.00 – 04.30 | Persiapan Sholat Shubuh |
| 04.30 – 05.00 | Sholat Shubuh berjamaáh |
| 05.00 – 05.30 | Dzikir pagi / Halaqoh Al Qurán |
| 05.30 – 06.00 | MCK / Haris K3 / Olah raga |
| 06.00 – 06.30 | Makan pagi bersama |
| 06.30 – 07.00 | Persiapan sekolah / Breafing pagi |
| 07.00 – 12.00 | Kegiatan Belajar Mengajar ( KBM ) |
| 12.00 – 12.30 | Sholat Dhuhur Berjamaáh |
| 12.30 – 13.00 | Qiroátul Qurán |
| 13.00 – 13.30 | Makan siang bersama |
| 13.30 – 14.30 | Istirahat siang |
| 14.30 – 15.00 | Persiapan Sholat Ashar |
| 15.00 – 15.30 | Sholat Ashar Berjamaáh |
| 15.30 – 16.00 | Dzikir sore / Hifdzul Hadits |
| 16.00 – 17.00 | Kegiatan Ektrakurikuler |
| 17.00 – 17.30 | MCK / Kebersihan Umum |
| 17.30 – 18.00 | Persiapan Sholat Maghrib |
| 18.00 – 18.15 | Sholat Maghrib Berjamaáh |
| 18.15 – 19.00 | Taushiyah |
| 19.00 – 19.30 | Sholat Isya’Berjamaáh |
| 19.30 – 20.00 | Makan Malam Bersama |
| 20.00 – 21.30 | Belajar Malam |
| 21.30 – 22.00 | Breafing Malam / Muhasabah Yaumiyyah |
| 22.00 – 03.00 | Istirahat Malam |
Ketentuan seragam :
Sabtu – Ahad : Baju koko putih, Celana hitam
senin – selasa : Baju putih, celana biru.
Rabu – Kamis : Baju khas SMP Al Muttaqin
